В дополнении к первой части Crysis мы видим ту же историю, произошедшую на заброшенном острове, но глазами другого человека. Разработчики учли некоторые ошибки оригинальной игры, добавили несколько новых сюжетных моментов, более подробно рассказав о Психе (англ. Psycho), другом участнике специальной команды «Хищник».
Чтобы понять события Warhead, нужно сначала в обязательном порядке пройти от и до основную игру. Сюжет здесь разжевывается мало, нас с ходу бросают в самые ожесточенные сражения, в самый центр пугающих событий. Предполагается также, что мы уже знакомы с возможностями костюма, вооружением и научились прилично стрелять. Никаких намеков на обучение тут нет, с самых первых минут на нас сваливаются армии опасных противников, и выжить в этом противостоянии, особенно на высокой сложности — ой как не просто. Если в первой части половину игры мы бились с одними корейцами, играли с ними в салочки и просто дурачились, наслаждались потрясающими видами на море, то здесь с самого старта мы встречаем и большое количество бронетехники, и тучи пришельцев, и даже множество противников в нанокостюмах.